La eficiencia del complejo sistema de investigación biomédica requiere un organigrama funcional eficiente y pluridisciplinar. En el 'IR-HUVH la estructura conjuga gestión y decisión (Órganos de Gobierno) organización, gestión económica y del conocimiento (estructura administrativa) y producción científica (personal investigador).

Órganos de Gobierno
La infraestructura de gestión y decisión del IR-HUVH recaen en la Fundació de Recerca de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron, cuyos órganos gestores son: el Patronato, la Junta de Gobierno, la Dirección y los Comités Científicos Externo e Interno..
Estructura administrativa
La estructura administrativa de apoyo a la investigación del IR-HUVH, con capacidad para gestionar, generar recursos y contratar personal técnico, se articula en tres unidades: Unidad de Gestión de Proyectos, Unidad de Gestión Económica y Unidad de Gestión del Conocimiento.
Personal investigador
El personal investigador está formado por científicos del Hospital Universitario Vall d'Hebron y científicos contratados por el IR-HUVH. Algunos de éstos también ejercecen de docentes en la UAB. La actividad científica del IR-HUVH se enmarca en 11 Áreas de Investigación, formadas por un total de 45 Grupos. El personal dedicado a labores de investigación está formado por 397 investigadores ( 81% médicos y el resto, biólogos, bioquímicos, farmacéuticos, psicólogos, químicos, veterinarios,...), junto a 48 investigadores postdoctorales, 219 investigadores predoctorales, además de 201 personas con funciones de apoyo a la investigación, entre los que figuran diplomados en enfermería, técnicos de laboratorio, administrativos personal auxiliar.