El servicio de RT-QPCR de la UCTS dispone de los Sistemas de detección de Secuencia (SDS) 7000 y 7900HT de la empresa Applied Biosystems.
El SDS 7000 incluye:
1. Termociclador: con un bloque de 96 pocillos; sistema de calentamiento basado en “Peltier”; como fuente de excitación dispone de una bombilla halógena de Tungsteno; la detección
de la fluorescencia se realiza mediante filtros de emisión optimizados para el uso de los fluorocromos FAM. NED, ROX, SYBR, TAMRA y VIC.
2. Ordenador Portatil PC Pentium III.
3. Softwares: ABI PRISM 7000 SDS versión 1.1 RQ para la recogida y análisis de datos de fluorescencia; PRIMER EXPRESS, para el diseño óptimo de cebadores y sondas.
4. Impresora Epson Stylus color 980.
El SDS 7900HT incluye:
1. Termociclador intercambiable, con bloque de 384 pocillos o bloque para targetas microfluídicas; sistema de calentamiento basado en “Peltier”; como fuente de excitación dispone de laser de argón; la detección de la fluorescencia se realiza mediante filtros de emisión optimizados para el uso de los fluorocromos FAM. NED, ROX, SYBR, TAMRA y VIC.
2. Ordenador PC Pentium®.
3. Dos lectores de codigos de barras.
4. Un sellador de targetas microfluídicas.
5. Softwares: ABI PRISM 7900HT SDS versión 2.2 para la recogida y análisis de datos de fluorescencia; PRIMER EXPRESS, para el diseño óptimo de cebadores y sondas.
6. Impresora hp deskjet 6122.
Aplicaciones del equipo
1. Estudios de cuantificación absoluta o relativa de perfiles transcripcionales.
2. Análisis del número de copias de un gen en DNAs genómicos o virales.
3. Estudios de discriminación alélica (SNPs) (detección de polimorfismos a nivel de nucleótidos).
4. Ensayos de detección e identificación de patógenos.
Además, el servicio de RT-QPCR de la UCTS actualmente realiza, a petición del usuario, otras técnicas asociadas y complementarias a la PCR cuantitativa a Tiempo Real:
1. Análisis de la calidad del RNA.
2. Asesoramiento en el diseño de cebadores y sondas mediante PRIMER EXPRESS.
3. Análisis e interpretación de datos de la reacción de RT-QPCR.
Relación de precios de este servicio.
Para más información con respecto a la preparación de muestras, o protocolos específicos, o si se desea poner a punto una técnica en particular, por favor contactar con: pcr@ir.vhebron.net y/o teléfono 93 489 4178
Técnico responsable: Francisca Gallego