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 Servicio de PCR Cuantitativa en Tiempo Real
 Servicio de Microarrays de Affymetrix 
 Servicio de Secuenciación
 Servicio de Bioanalyzer       

El servicio de RT-QPCR de la UCTS dispone de los Sistemas de detección de Secuencia (SDS) 7000 y 7900HT de la empresa Applied Biosystems.

El SDS 7000 incluye:

1.      Termociclador:  con un bloque de 96 pocillos; sistema de calentamiento basado en “Peltier”; como fuente de excitación dispone de una bombilla halógena de Tungsteno; la detección de la fluorescencia se realiza mediante filtros de emisión optimizados para el uso de los fluorocromos FAM. NED, ROX, SYBR, TAMRA y VIC.
2.      Ordenador Portatil PC Pentium III.
3.      Softwares: ABI PRISM 7000 SDS versión 1.1 RQ para  la recogida y análisis de datos de fluorescencia; PRIMER EXPRESS, para el diseño óptimo de cebadores y sondas.
4.      Impresora Epson Stylus color 980.

El SDS 7900HT incluye:

1.      Termociclador intercambiable, con bloque de 384 pocillos o bloque para targetas microfluídicas; sistema de calentamiento basado en “Peltier”; como  fuente de excitación dispone de laser de argón; la detección de la fluorescencia se realiza mediante filtros de emisión optimizados para el uso de los fluorocromos FAM. NED, ROX, SYBR, TAMRA y VIC.
2.      Ordenador PC Pentium®.
3.      Dos lectores de codigos de barras.
4.      Un sellador de targetas microfluídicas.
5.      Softwares: ABI PRISM 7900HT SDS versión 2.2 para la recogida y análisis de datos de fluorescencia; PRIMER EXPRESS, para el diseño óptimo de cebadores y sondas.
6.       Impresora hp deskjet 6122.


Aplicaciones del equipo
1.      Estudios de cuantificación absoluta o relativa de perfiles transcripcionales.
2.      Análisis del número de copias de un gen en DNAs genómicos o virales.
3.      Estudios de discriminación alélica (SNPs) (detección de polimorfismos a nivel de nucleótidos).
4.      Ensayos de detección e identificación de patógenos.

Además, el servicio de RT-QPCR  de la UCTS actualmente realiza, a petición del usuario, otras técnicas asociadas y complementarias a la PCR cuantitativa a Tiempo Real:

1.      Análisis de la calidad del RNA.
2.      Asesoramiento en el diseño de cebadores y sondas mediante  PRIMER EXPRESS.
3.      Análisis e interpretación de datos de la reacción de RT-QPCR.

 Relación de precios de este servicio.

Para más información con respecto a la preparación de muestras, o protocolos específicos, o si se desea poner a punto una técnica en particular, por favor contactar con: pcr@ir.vhebron.net    y/o teléfono 93 489 4178

Técnico responsable: Francisca Gallego

El servicio de Análisis de expresión génica mediante microarrays de la UCTS participa en la agrupación Genechip (Empresa proveedora: Affymetrix Inc.) financiada por Genoma España  y dispone del Sistema GeneChip® de Affymeytrix que incluye:


1.      Horno de hibridación con eje rotatorio modelo 640.
2.      Dos estaciones de fluidos modelo 450.
3.      Scanner 3000 con estación de trabajo y cargador automático de arrays.
4.      Herramientas informáticas de Minería de Datos (Data Mining Tool, DMT, de Affymetrix).

Servicio que se ofrece

Nota: La obtención de ARN total la realizará el cliente. Se recomienda utilizar el RNAeasy minikit (Qiagen) y el seguimiento exacto de su protocolo de uso. Los ARNs deberían ser enviados en gel seco utilizando un servicio de mensajería.

Una vez recibidas las muestras, el servicio de Microarrays de Affymetrix de la UCTS llevará a término los seguientes pasos:

1.      Re-Análisis de la cantidad y calidad del ARN total recibido utilizando el Bioanalyzer de Agilent.
2.      Generación de cADN utilizando los kits One-Cycle Target Labeling kit o el Two-Cycle Labeling kit (Affymetrix) dependiendo de la cantidad recibida de ARN total.
3.      Síntesis de cARN biotinilado utilizando el GeneChip IVT Labeling kit (Affymetrix). La calidad de la síntesis del cARN será analizada utilizando el Bioanalyzer de Agilent.
4.      Fragmentación del cARN. La eficacia de la fragmentación será analizada utilizando el Bioanalyzer de Agilent.
5.      Los cARNs serán utilizados para comprobar su calidad en una hibridación “prueba”, utilizando los TestArray chips (Affymetrix). Si la calidad del cARN es satisfactoría se procederá a la hibridación de la muestra con el GeneChip de interés (Affymetrix).
6.         Los resultados serán enviados al cliente en una "memoria de resultados" que incluirá histogramas de los pasos realizados para la generación de cARN, así como una pre-Análisis de los datos de expresión finales.

Además de este servicio, el servicio de Análisis de expresión génica ofrece asesoramiento sobre el diseño experimental para estudios de transcriptómica y análisis completo de los resultados. ¡¡¡ NUEVO !!!  Además, este servicio también ofrece la posibilidad de resecuenciar el genoma mitocondrial humano completo usando los microarrays MitoChip de Affymetrix.

 Relación de precios de este servicio

Para más información acerca de la preparación de muestras, o protocolos específicos, o si se desea poner a punto una técnica en particular, por favor contactar con: arrays@ir.vhebron.net  y/o teléfono 4178

Técnico responsable: Fátima Nuñez

Los secuenciadores automáticos de los que dispone la UCTS són:


Analizador Genético  ABI PRISM 310 de la empresa Applied Biosystems, compuesto por:

1.      Unidad de electroforesis capilar de 1 capilar
2.      Muestrador automático para placas de 48 pocillos
3.      Unidad de detección con cámara CCD y filtros virtuales de separación de la luz emitida.
4.      Unidad óptica con láser iónico de Ar.
5.      Ordenador PC Pentium® con los programas de captación de datos Collection v1.1, GeneMapper v3.0 y SeqScape 2.0 y los programas de análisis Sequencing Analysis v3.7  y GeneScan.



Analizador Genético ABI PRISM 3100 de la empresa Applied Biosystems, compuesto por:

1.      Unidad de electroforesis capilar de 16 capilares
2.      Muestrador automático para placas de 96 y 384 pocillos
3.      Unidad de detección con cámara CCD y filtros virtuales de separación de la luz emitida
4.      Unidad óptica con láser iónico de Ar emisión de 488 y 514 nm.
5.      Ordenador PC Pentium® con los programas de captación de datos Collection v1.1, GeneMapper v3.0 y SeqScape 2.0 y  los programas de análisis Sequencing Analysis v3.7  y GeneScan.

Aplicaciones del equipo

1.      Secuenciación  de novo de secuencias de ADN de todo tipo: monocatenario, bicatenario, plásmidos, cósmidos, fagos, BACS, YACS, ADN mitocondrial y productos de PCR de cualquier tamaño.
2.      Análisis de fragmentos de ADN marcados con fluorescencia
3.      Análisis de microsatélites (STRs, VNTRs)
4.      Detección de mutaciones por cambio de movilidad (SSCP)
5.      Análisis de mutaciones puntuales (SNP)
6.      Cuantificación relativa como medida de expresión de mRNA o dosis génica (técnica de QFPCR para  detección de aneuplidias)

¡¡¡ NUEVO !!!  Además, este servicio ofrece la possibilidad de hacer la reacción de secuencia a partir de DNA plasmídico o producto de PCR y posterior purificación mediante el kit Montage SEQ96 Sequencing Reaction Cleanup de Millipore. A continuación adjuntamos las condiciones necesarias de las muestras para traerlas a la UCTS

 Relación de precios de este servicio

Para más información sobre preparación de muestras, protocolos específicos o si desea poner a punto una técnica en particular, por favor no dude en ponerse en contacto con: seq@ir.vhebron.net  y/o teléfono 4177

Técnico responsable: Rosa Arjona

El servicio de Bioanalyzer de la UCTS és:


1 Bioanalyzer de Agilent

Aplicaciones del equipo:

1.     Servicio de cuantificación y determinación de la calidad del ARN.
2.     Análisis, separación y cuantificación de fragmentos de ADN.

 Relación de precios de este servicio

Para más información sobre  preparación de muestras, o protocolos específicos, o si se desea poner a punto una técnica en particular, por favor contactar con: array@ir.vhebron.net   y/o teléfono 93 489 4178

Técnicos responsables: Francisca Gallego y Ricardo Gonzalo